Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Scara5Q8K299 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scara5Q8K299 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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