Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Abcf3Q8K268 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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