Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Sde2Q8K1J5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms