Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pnma3Q8JZW8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms