Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Upp2Q8CGR7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms