Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Gm9955Q8CEJ8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms