Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc28aQ8CEI3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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