Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx30Q8CE50 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms