Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhl11Q8CE33 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms