Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fam228aQ8CDW1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms