Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ephb1Q8CBF3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Ephb1Q8CBF3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ephb1Q8CBF3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ephb1Q8CBF3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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