Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms