Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Spef2Q8C9J3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Spef2Q8C9J3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms