Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7I4

Apol9b, Apolipoprotein L 9b, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9bQ8C7I4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Apol9bQ8C7I4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apol9bQ8C7I4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms