Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Cnot2Q8C5L3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms