Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rft1Q8C3B8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rft1Q8C3B8 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rft1Q8C3B8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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