Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hdac7Q8C2B3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hdac7Q8C2B3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms