Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Snx16Q8C080 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx16Q8C080 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx16Q8C080 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx16Q8C080 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx16Q8C080 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx16Q8C080 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Snx16Q8C080 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx16Q8C080 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx16Q8C080 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx16Q8C080 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx16Q8C080 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Snx16Q8C080 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms