Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trerf1Q8BXJ2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trerf1Q8BXJ2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms