Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbbp5Q8BX09 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms