Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ctdsp2Q8BX07 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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