Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pdcl3Q8BVF2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms