Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT35

Smim37, Small integral membrane protein 37, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim37Q8BT35 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim37Q8BT35 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim37Q8BT35 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms