Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Fbxo38Q8BMI0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fbxo38Q8BMI0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms