Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c2Q8BL74 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms