Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN9

Uncharacterized protein C1orf115 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGN9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGN9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGN9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGN9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGN9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGN9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGN9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGN9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGN9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGN9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGN9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8BGN9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8BGN9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms