Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ubp1Q811S7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ubp1Q811S7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ubp1Q811S7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ubp1Q811S7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ubp1Q811S7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ubp1Q811S7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ubp1Q811S7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ubp1Q811S7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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