Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pcdh8Q7TSK3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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