Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnf1Q7TSH7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms