Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms