Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms