Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zfp397Q7TNK4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zfp397Q7TNK4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms