Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdcl2Q78Y63 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdcl2Q78Y63 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms