Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Higd1cQ76I25 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms