Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SynmQ70IV5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SynmQ70IV5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms