Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cnih3Q6ZWS4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cnih3Q6ZWS4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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