Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Topbp1Q6ZQF0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Topbp1Q6ZQF0 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms