Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tfap2eQ6VUP9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tfap2eQ6VUP9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms