Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
GcsamQ6RFH4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
GcsamQ6RFH4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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