Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6PD19 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q6PD19 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q6PD19 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q6PD19 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q6PD19 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6PD19 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6PD19 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6PD19 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6PD19 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6PD19 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6PD19 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6PD19 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6PD19 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6PD19 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6PD19 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q6PD19 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms