Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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Zbtb40Q6PCS8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zbtb40Q6PCS8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms