Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slf2Q6P9P0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf2Q6P9P0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf2Q6P9P0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf2Q6P9P0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf2Q6P9P0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf2Q6P9P0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf2Q6P9P0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Slf2Q6P9P0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slf2Q6P9P0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms