Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc148Q6P5U8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms