Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Podnl1Q6P3Y9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms