Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec23ipQ6NZC7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms