Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mvb12bQ6KAU4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mvb12bQ6KAU4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Mvb12bQ6KAU4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Mvb12bQ6KAU4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Mvb12bQ6KAU4 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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Mvb12bQ6KAU4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Mvb12bQ6KAU4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mvb12bQ6KAU4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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