Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CltbQ6IRU5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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