Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rftn1Q6A0D4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms