Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Jmjd1cQ69ZK6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Jmjd1cQ69ZK6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms