Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Samd9lQ69Z37 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd9lQ69Z37 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms